۱. التصحیح و التعلیق علی اختیار معرفة الرجال المعروف برجال الکشی • اختیار معرفة الرجال، مؤسسة آل البیت علیهم السلام لإحیاء التراث، قم، ۱۴۰۴ق.، 2 جلد، محقق: مهدی رجائی

۲. حاشیة علی الاستبصار • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۳. حاشیة علی قواعد العلامة • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۴. حاشیة علی مختلف العلامة • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۵. رسالة فی وجوب صلوة الجمعة • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۶. حاشیة علی نفلیة الشهید • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۷. خطب جمة لصلوة الجمعة • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۸. شارع النجاة • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۹. عیون المسائل • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۱۰. اربعة ایام • میراث اسلامی ایران، کتابخانه بزرگ حضرت آیت الله العظمی مرعشی نجفی (ره)، گنجینه جهانی مخطوطات اسلامی، چاپ اول، قم، ۱۳۷۳ش.، 10 جلد • کنگره بزرگداشت آقا حسین خوانساری، چاپ اول، قم، ۱۳۷۷ش.

۱۱. الصراط المستقیم فی ربط الحادث بالقدیم • کتابخانه، موزه و مرکز اسناد مجلس شورای اسلامی، چاپ اول، تهران، ۱۳۸۱ش.، مصحح: علی اوجبی

۱۲. شرح الصحیفة السجادیة الکاملة به اهتمام: محمود بحرالعلوم میردامادی • مهدیه میرداماد، اصفهان، ۱۴۰۶ق.، محقق: مهدی رجائی، اشراف: محمود بحرالعلوم میردامادی

۱۳. شرعة التسمیة حول حرمة تسمیة صاحب الأمر باسمه الأصلی فی زمان الغیبة • مهدیه میرداماد، چاپ اول، اصفهان، ۱۴۰۹ق.

۱۴. کلمات القصار فی المواعظ و النصایح • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۱۵. نبراس الضیاء و تسواء السواء فی شرح باب البداء و اثبات جدوی الدعاء سرشناسه: محمد باقر بن محمد میرداماد • مؤسسه انتشارات هجرت، چاپ اول، قم، ۱۳۷۴ش.، با مقدمه: حامد ناجی اصفهانی، با تعلیق: حکیم ملا علی نوری، مصحح: حامد ناجی اصفهانی

۱۶. القبسات به کوشش: دکتر مهدی محقق • دانشگاه تهران، موسسه چاپ و انتشارات، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۴ش.

۱۷. مجموعه فلسفه عرفان جذوات • بهنام، ایران، ۲ش.

۱۸. السبع الشداد • مطبعة الاسلام، قم، ۱۳۱۷ق.، خطاط: محمود بروجردی • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۱۹. شرح تقدمة تقویم الأیمان فی فضائل أمیر المؤمنین علیه السلام • مهدیه میرداماد، چاپ اول، اصفهان، ۱۴۱۲ق.

۲۰. التعلیقة علی کتاب الکافی • چاپخانه خیام، قم، ۱۴۰۳ق.، محقق: مهدی رجائی

۲۱. الاعضالات • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۲۲. حدیث التمثیل • اثنی عشر رسالة، تهران، با مقدمه: آیة الله سید شهاب الدین مرعشی نجفی، خطاط: احمد نجفی زنجانی

۲۳. تقویم الایمان و شرحه کشف الحقائق نویسنده: احمد بن زین العابدین علوی عاملی • مرکز پژوهشی میراث مکتوب، چاپ دوم، تهران، ۱۳۸۵ش.، محقق: علی اوجبی، با مقدمه: علی اوجبی، با تعلیق: حکیم ملا علی نوری

۲۴. الأفق المبین • مرکز پژوهشی میراث مکتوب، چاپ اول، تهران، ۱۳۹۱ش.، محقق: حامد ناجی اصفهانی، با مقدمه: حامد ناجی اصفهانی

۲۵. امانت الهیه • الرسائل المختاره، کتابخانه عمومی ‌امام‌ ‌امیر‌المومنین‌ ‌علی‌ ‌علیه‌‌السلام‌، اصفهان، ۱۳۶۸ش.، مصحح: احمد تویسرکانی

۲۶. دیوان اشراق به کوشش: سمیرا پوستین دوز پیشگفتار: جویا جهانبخش • مرکز پژوهشی میراث مکتوب، چاپ اول، تهران، ۱۳۸۵ش.